Penemuan sumur jobong ini terjadi secara tidak sengaja pada 8 Oktober 2018 ketika para pekerja melakukan penggalian proyek box culvert di Jalan Pandean Gang I, sebuah kawasan yang kini padat penduduk dengan rumah-rumah berdempetan tanpa halaman samping, sementara jalan kampungnya hanya selebar 3–4 meter. Sumur jobong yang ditemukan memiliki struktur bertumpuk tiga, ditemukan di kedalaman satu meter dengan kondisi masih berada pada posisi aslinya atau insitu, dengan koordinat 49 M 0651513 9164442. Saat ditemukan, bagian atas sumur tertutup tanah liat dan air limbah rumah tangga sehingga hanya terlihat bagian jobong pertama dan kedua, sementara bagian ketiganya terendam air.

Tim dari Balai Pelestarian Cagar Budaya (BPCB) Trowulan yang turun langsung ke lokasi melakukan pengukuran, pendokumentasian, dan identifikasi fragmen tembikar yang ada di sekitar sumur. Berdasarkan hasil pengamatan awal, sumur ini memiliki kemiripan dengan sumur jobong pada masa Kerajaan Majapahit. Sumur jobong pada masa itu tidak hanya berfungsi sebagai sumber air bersih untuk kebutuhan rumah tangga, tetapi juga memiliki peran penting dalam kegiatan keagamaan dan digunakan sebagai sumber air untuk kegiatan pertanian skala kecil, seperti menyiram tanaman pada musim kemarau. Penemuan sumur jobong ini tidak hanya menjadi bukti adanya teknologi pemanfaatan air bersih masyarakat masa lalu, tetapi juga menguatkan dugaan bahwa kawasan Peneleh telah menjadi pusat aktivitas masyarakat dan berkembangnya peradaban lokal di Surabaya pada masa lampau.